Sistemática y ecología microbiana

Centro de Investigaciones Biológicas Del Noroeste S. C.
En La Paz

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  • Curso
  • La paz
  • Duración:
    1 Cuatrimestre
Descripción

Objetivo del curso: Proporcionará a los estudiantes un conocimiento profundo sobre la diversidad microbiana (Bacteria y Arquea), diversidad metabólica, su evolución y su participación en los ecosistemas.

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Instalaciones

Dónde se imparte y en qué fechas

Inicio Ubicación
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La Paz
Mar Bermejo No. 195, Col Playa Palo de Santa Rita, 23000, Baja California Sur, México
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Programa académico

Temas y Subtemas

Unidad I. Diversidad del Dominio Bacteria (4 sesiones de 2 horas c/u)

  • Reino I: Proteobacteria
  • ReinoII: Bacterias Gram positivas
  • Reino III: Cianobacterias
  • Reino IV: Clamidias
  • Reino V: Planctomices
  • Reino VI: Bacteroides/Flavobacteria
  • Reino VII: Bacterias verdes del azufre
  • Reino VIII: Espiroquetas
  • Reino IX: Deinococos
  • Reino X: Bacterias verdes no sulfurosas
  • Reino XI: Hipertermofilos

Unidad IB. Diversidad del Dominio Arquea (1 sesiones de 2 horas c/u)
1B.1 Reino I: Euriarqueota
1B.2 ReinoII: Crenarqueota
1B.3 Reino III. Korarqueota

Unidad II. Diversidad Metabólica (5 sesiones de 2 horas c/u)

  • Conservación de energía y metabolismo del carbono
  • Fotosíntesis oxigénica
  • Fotosíntesis anoxigénica
  • Fotosíntesis basada en bacteriorodopsina
  • Quimiolitotrofía
  • Respiración anaerobia
  • Metanogénesis
  • Diversidad fermentativa
  • Fijación de nitrógeno

Unidad III Ecología Microbiana (7 sesiones de 2 horas c/u)

  • Habitats microbianos especializados
  • Actividad de microorganismos en la naturaleza
  • Crecimiento de microorganismos en la naturaleza
  • Actividad metabólica de microorganismos en la naturaleza
  • Concepto de nicho ecológico
  • Superficies, biofilms y tapetes microbianos laminados
  • Relaciones biológicas
  • Competencia
  • Cooperación
  • Sintrofía
  • Parasitismo
  • Niveles de organización
  • Individuo
  • Poblaciones
  • Gremios
  • Comunidades
  • Ecosistemas
  • Biosfera
  • Ciclos biogeoquímicos/estados redox
  • Ciclo del carbono
  • Ciclo del azufre
  • Ciclo el nitrógeno
  • Métodos convencionales en ecología microbiana
  • Columna de Winogradsky
  • Agar agitado en tubo
  • Enriquecimiento sesgado
  • Nuevos métodos en ecología microbiana
  • Microscopía confocal
  • Conteo celular: naranja de acridina y DAPI
  • Sondas moleculares específicas
  • Fraccionamiento isotópico
  • Microelectrodos
  • Reacción en cadena de polimerasa (PCR)
  • Electroforesis en gradiente de geles desnaturalizantes (DGGE), T-RFLP
  • Metagenómica
  • El concepto de metagenoma (genomas colectivos)
  • Tecnologías de secuenciación masiva
  • Etapas de la investigación en metagenómica
  • La aproximación ecologia de la metagenómica

Unidad IV Sistemática y evolución microbiana (7 sesiones de 2 horas c/u)

  • Historia evolutiva de los microorganismos
  • Teoría Oparin/Haldane/Orígenes de la vida
  • Microfósiles y estromatolitos
  • Geoquímica: fósiles químicos
  • Teoría de endosimbiosis serial/origen de las células eucariotes
  • Cronómetros evolutivos
  • Secuenciación de RNA ribosomales y evolución celular
  • Construcción de árboles filogenéticos
  • Definiciones: identificación, clasificación, taxonomía, sistemática, nomenclatura
  • Sistemas de clasificación de los microorganismos
  • Cinco reinos: Monera, Protoctista, Fungi, Animal, Planta
  • Tres dominios: Arquea, Bacteria, Eucaria
  • Taxonomía polifásica
  • Concepto de especie en bacterias


Actividades de Aprendizaje

  • Pláticas apoyadas con material audiovisual, acetatos, diapositivas videos, mesas redondas, consultas a internet y a biblioteca (bancos de información).


Modalidades de evaluación de la asignatura.

  • Presentación de cuatro exámenes escritos (60 puntos), cuatro tareas (20 puntos), presentación y discusión de presentaciones orales de temas específicos o artículos de investigación (20 puntos).

Criterios de Evaluación
1. Para poder acreditar el curso en su totalidad cada uno de los alumnos deberá acreditar con calificación mínima de 8 (ocho), cada una de las unidades. Calificaciones menores a 7.8 no son aprobatorias!! Y no promedian para la calificación final. Calificaciones con decimales de 0.8 y 0.9 se redondean al siguiente número superior. Calificaciones menores e iguales a 0.7 se redondean al siguiente número inferior.
2. Para poder acreditar el curso los alumnos deben cubrir más del 85% de asistencia de todo el curso, sin excepción. La asistencia mínima para cada una de las unidades deberá ser de 8 y 10 horas. Faltas por 2 horas en tres unidades son consideradas suficientes para no acreditar la asignatura.
3. A todos los alumnos se les solicita atentamente asistir puntualmente a clase y no tener sobrepuestas otras actividades en el mismo horario de la asignatura.


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